在日常使用过程中，管理人员要注意不要在屋顶花园中随意添加超出原设计范围的大型景物，以免屋顶超载。改变原有隐蔽水电设备和系统时，要特别注意保护好原有屋面的防水层和防水结构。屋顶的防水系统和防水坡度不得轻易改变。园内枯叶、杂物要及时清理，防止堵塞排水口和排水通道。只要屋顶没水，就不容易担心漏水。

在屋顶施工中，土建工程和园林工程的相互配合是建造屋顶花园的另一个关键。在园林工程中，屋面上要预留大量的预埋铁件和扶壁，给屋面的整体防水层增加了弱点，下沉的种植池和水池也给防水层的施工带来了困难。这些都需要严格按照图纸施工，精心操作，完成每个节点的防水构造处理。

园林屋顶建成后的管理主要是指园林主体景观中各种地被植物、花草树木的养护管理。当然也要结合屋顶水电设施和结构的维护，防水排水等。一般来说，这些工作应该由具有园林绿化种植和维护经验的专业人员来完成。

屋顶花园设计的前提是荷载问题。花园设计的屋顶应采用整体浇筑或预制的钢筋混凝土屋面板作为结构层，并要求提供每平方米350公斤以上的附加荷载能力。为减轻荷载，在承重结构中或跨度较小的位置设置重量较大的亭、廊、花坛、水池、假山等景点，尽量选用人造土、泥炭土、腐殖土等轻质材料。